Malheureusement cela peut venir de beaucoup de chose, il faut tester petit à petit pour trouver le problème.
Soit le cuissard est neuf ou la peau ne te convient pas.
Soit c'est un problème de réglage de selle, va voir ton mécano ou bien fait les réglages toi même en t'appuyant sur les instructions de réglages que l'on peux trouver sur le net. Hauteur de selle, inclinaison, profondeur.
Soit ça vient de la selle elle même qui n'est pas adapté à ta morphologie (taille de bassin). Toute les selles ont des longueurs et largeurs différentes avec des bec plus ou moins court. Perso il me faut une 143 de large, j'ai essayé des San Marco moins large et au bout d'heure plus possible de m'assoir dessus tellement j'avais mal.
Je pense qu'il faut que tu revois tes réglages et si cela persiste va voir avec ton mécano pour essayer d'autres selles jusqu'à trouver la bonne.
Ne t'inquiète pas c'est un problème auquel tous cyclisme est confronté un jour ou l'autre et le seul docteur qui puisse t'aider c'est ton revendeur cycle.
Bon courage.